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石河子开发区于1992年经自治区人民政府批准成立，2000年4月，升格为国家级开发区，规划面积11.2平方公里，2012年8月，国务院批准开发区扩区9.9平方公里。2006年3月，自治区人民政府批准设立石河子北工业园区，规划面积31.2平方公里；2010年9月，兵团批准设立石河子化工新材料产业园，规划面积20.3平方公里。为发挥开发区管委会在体制、机制、招商、政策等方面的优势，师市党委委托开发区党工委、管委会对上述园区及辐射区进行统一规划、统一建设和统一管理，实际管辖面积86.8平方公里。
按照“小政府、大服务”和“精简、效能”的原则，开发区管委会设立了办公室、招商局、财政局、经济发展局、规划建设局、城市管理局、社会发展局、组织人事局。公安、交警、司法、工商、税务、质监、国土资源等部门在开发区设立了办事机构，基本形成了“一站式”服务的格局。
得益于开发区的持续、快速、健康发展，2010年，开发区荣获了“国家加工贸易梯度转移承接地”、“国家新型工业化示范基地”称号，石河子市荣获了“国家新材料高新技术产业化基地”和“中国棉纺织名城”称号。
自1992年建区以来，开发区实现了跨越发展，已成为带动师市经济快速发展的“排头兵、领头羊、生力军”。2016年，开发区党工委、管委会继续加大招商引资力度，在加快现有产业发展的同时，重点建设纺织、食品饮料、装备制造、新材料和现代服务业六大产业基地。2016年开发区实现生产总值215.6亿元，同比增长10.5%，其中：工业增加值138亿元，同比增长6.2%；三产增加值完成61.5亿元，同比增长33.6%；完成税收42亿元，同比增长34.4%；完成固定资产投资111.5亿元；招商引资到位资金180.2亿元。
2017年开发区计划完成生产总值233.8亿元，同比增长8.4%；其中：工业增加值151.8亿元，同比增长10%；第三产业增加值68亿元，同比增长10.6%。