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梅河口市产业发展优势明显，重点打造医药健康、食品加工、商贸物流、现代服务业四大主导产业。医药健康产业发展潜力和后劲巨大，引进了康美药业、四环医药、步长制药、国药集团等国内排名前列的企业集团，医药工业产值占工业经济的43%，总量占全省的14.3%。食品加工产业形成了以玉米、果仁、绿优米深加工为主的产业体系，是亚洲最大的树生果仁加工集散地、亚洲最大的食用酒精生产地、中国最大的肥肝生产地。商贸物流产业建设了全省一流的建材、汽贸、农贸等八大专业批发市场，是吉林省东南部商贸中心和物流集散中心。现代服务业与社会事业、现代农业、全域旅游融合发展，加快建设区域医疗、教育、文体“三个中心”，全力打造全省现代服务业示范区。

梅河口经济开发区于2002年经省政府批准设立，是省级经济开发区，副县级建制，主要职能是招商引资、项目建设、固定资产投入和基础设施建设。先后被评为“深港企业投资潜力城市‘’全国最佳投资环境工业园区中国最具发展潜力工业园区”。2008年12月，开发区与中科院共同建立了全国第一家县级高新技术产业转化工作站。开发区规划面积8.54平方公里，区内企业已达236户，其中外商投资企业14户。现有生物医药、果仁食品、轻工机械、冶金化工、商贸物流5个产业区。有世界最大的树生果仁生产加工集散地、亚洲最大的玉米转化优级食用酒精生产地、全国最大的鹅鸭肝生产地、全国最大的油田抽油泵管生产地、东北重要的海绵钛生产地、吉林省东南部绿优米生产加工集散地、吉林省东南部最大的能源生产集聚地、吉林省东南部中医药和生物制药生产基地。区域内鑫利达汽车农用车交易市场居东北第二，长白山建材城居吉林省第二，金铎农贸批发市场是全国农产品综合批发百强市场。